« Chromosome 3 » : différence entre les versions
| (31 versions intermédiaires par 2 utilisateurs non affichées) | |||
| Ligne 1 : | Ligne 1 : | ||
=Caractéristiques générales= | =Caractéristiques générales= | ||
*Taille du chromosome : 6.7 cm<br> | *'''Taille du chromosome :''' 6.7 cm<br> | ||
*Nombres de paires de bases : 199’501’827 pb<br> | *'''Nombres de paires de bases :''' 199’501’827 pb<br> | ||
*Nombres de gènes : 1’150<br> | *'''Nombres de gènes :''' 1’150<br> | ||
*Lieu de séquençage: Allemagne, Chine, Royaume-Uni et USA<br> | *'''Lieu de séquençage:''' Allemagne, Chine, Royaume-Uni et USA<br> | ||
*Gène impliqué :<br> | *'''Gène impliqué :'''<br> | ||
**dans la vision nocturne<br> | **dans la vision nocturne<br> | ||
**dans la régulation de l'appétit<br> | **dans la régulation de l'appétit<br> | ||
| Ligne 13 : | Ligne 13 : | ||
==La Bioinformatique== | ==La Bioinformatique== | ||
La | La bioinformatique constitue u'''n large ensemble de techniques et concepts qui sont nécessaires pour comprendre l'information génétique''', comme par exemple les génomes. | ||
La technique qui nous intéresse est '''le séquençage des gènes et des protéines'''. Elle permet de classer les organismes suivant leurs différences génétiques (Phylogénie), mais aussi de savoir quel gène code quelle protéine, et de connaitre la structure des protéines.<br> | |||
C'est | C'est une science où une grande variété de métiers s'entraident: des biologistes, des informaticiens, des mathématiciens et des physiciens. | ||
== | ===Ses limites=== | ||
'''Une certaine complexité''' du matériel génétique dépasse la bioinformatique, qui ne peut détecter lorsque: | |||
*'''Certaines gènes ne codent que pour une seule protéine.''' | |||
*'''D'autres codent pour plusieurs protéines à la fois, par l'épissage alternatif.''' | |||
*'''Plusieurs gènes, dans le code génétique entier, codent pour la même protéine.''' | |||
Le deuxième cas est celui de l'un des gènes du chromosome 3, codant pour deux protéines différentes, que personne n'avait pu détecter avec la bioinformatique auparavant. <br> | |||
==Le gène impliqué dans la régulation de l'appétit== | |||
Ici, les deux protéines impliquées dans le contrôle de l'appétit, mais '''codées par un seul gène''' : | |||
* '''La Ghréline''', qui avertit le corps lorsque celui-ci a besoin de nutriments | |||
* '''L'Obestatine''', qui avertit lorsque le corps est suffisamment rassasié | |||
C'est '''leur équilibre qui maintient le corps en bonne santé''', car s'il est rompu, l'organisme peut tendre vers l'obésité ou l'anorexie. Il faut toutefois rappeler que notre appétit est aussi guidé par nos émotions et nos habitudes alimentaires, un dérèglement peut être donc dû à des facteurs physiologiques, psychologiques, ou culturels.<br> | |||
=Développement par questions= | |||
== | ==Comment se fait-il qu'un gène puisse coder plusieurs protéines différentes?== | ||
Comme dans ce cas, '''la Ghréline et l'Obestatine sont deux protéines synthétisées à partir du même gène'''. | |||
Cela est possible par l' '''épissage alternatif''': | |||
Lors de la synthèse des protéines, une fois que l'ARN s'est fait transcrire mais avant qu'il sorte du noyau, il doit passer par '''une étape de maturation''' (pour donner un ARNm mature) celle-ci comportant trois étapes: | |||
*'''l'ajout d'une queue poly-A sur l'extrémité 3'''' | *'''l'ajout d'une queue poly-A sur l'extrémité 3'''' | ||
*'''l'ajout d'une coiffe 5'''' | *'''l'ajout d'une coiffe 5'''' | ||
*'''l'épissage''' | *'''l'épissage''' | ||
C'est cette dernière partie qui permet que deux protèines puissent être produites par un seul | C'est cette dernière partie qui permet parfois que deux protèines puissent être produites par un seul gène, car dans cette étape, l'ARNm est épuré de ses parties non-codantes (nommées '''introns''') pour qu'il ne reste plus que les parties codantes pour des protéines (celles ci nommées '''exons'''). | ||
Seulement, il peut y avoir un épissage alternatif, '''mécanisme parfaitement identique''', sauf que '''certains exons peuvent aussi se faire éliminer parmi les introns'''. Cela faisant plusieurs types d'ARNm matures, certains possédant des exons que d'autres n'ont pas et inversement: '''des protéines donc différentes vont être synthétisées''', comme ici pour la Ghréline et l'Obestatine. | Seulement, il peut y avoir un épissage alternatif, '''mécanisme parfaitement identique''', sauf que '''certains exons peuvent aussi se faire éliminer parmi les introns'''. Cela faisant plusieurs types d'ARNm matures, certains possédant des exons que d'autres n'ont pas et inversement: '''des protéines donc différentes vont être synthétisées''', comme ici pour la Ghréline et l'Obestatine. | ||
==Anorexie et Boulimie: problèmes simplement liés aux | Voir Annexe 1 | ||
==Anorexie et Boulimie: problèmes simplement liés aux gènes?== | |||
C'est une '''question controversée''', car actuellement '''le taux des cas anorexiques subit une très forte hausse''': c'est '''la surenchère des médias qui utilisent de plus en plus de filles maigres que l'ont suspecte coupable.''' Tout d'abord, les jeunes filles (et les jeunes hommes mais plus rarement) se font donc un idéal physique lié à ces modèles, et cela leur est destructeur. | C'est une '''question controversée''', car actuellement '''le taux des cas anorexiques subit une très forte hausse''': c'est '''la surenchère des médias qui utilisent de plus en plus de filles maigres que l'ont suspecte coupable.''' Tout d'abord, les jeunes filles (et les jeunes hommes mais plus rarement) se font donc un idéal physique lié à ces modèles, et cela leur est destructeur. | ||
Les deux protéines (Ghréline et Obestatine), suivant leur équilibre, '''favorisent''' donc ce déséquilibre psychologique. | Les deux protéines (Ghréline et Obestatine), suivant leur équilibre, '''favorisent''' donc ce déséquilibre psychologique: le gène qui les code est appelé '''gène de prédispositions'''. (voir Question " Qu'est ce qu'un gène de prédisposition?") | ||
Alors pourquoi ce fait-il que ce problème ne se rencontre pas dans les pays en voie de développement? | Alors pourquoi ce fait-il que ce problème ne se rencontre pas dans les pays en voie de développement? | ||
On pense que là où la nourriture est encore considérée comme difficile d'accès, et où toute son importance est véritablement comprise, il | On pense que là où la nourriture est encore considérée comme difficile d'accès, et où toute son importance est véritablement comprise, il faudrait un déséquilibre génétique plus important que dans les pays occidentaux. | ||
== Qu'est ce qu'un gène de prédisposition? == | |||
Un '''gène de prédisposition''' va faire tendre l'organisme vers un '''déséquilibre''', '''une maladie''' ou bien même '''un cancer''': Cela va '''augmenter ses chances de contracter ces pathologies''' sans toutefois l'y condamner. On peut donc maintenant, en examinant le matériel génétique, prédire ses chances de tomber malade plus tard de telle ou telle maladie ou cancer, et donc de faire des statistiques sur les chances de morts. Ceci donne un problème étique à cette démarche qui se voulait préventive, ainsi qu'un problème qui influencerait les assurances. | |||
La difficulté de ce | Il y a bien-sûr aussi des gènes de prédispositions '''pour des maladies jugées psychologiques''', comme la '''dépression'''. La réelle difficulté de ce sujet est le fait que les facteurs culturels et physiologique influencent eux aussi le malade. | ||
Justement pour le cas de la dépression, c'est une maladie psychologique où le gène (5-HTTLPR), impliqué dans le transport de la sérotonine, influence le développement de la maladie suivant sa longueur courte ou sa longueur longue. D'après les statistiques, si une personnes possèdent les gènes courts, elle a 4 fois plus de chance de contracter une dépression qu'une autre ayant les gènes longs. | |||
=Bibliographie= | =Bibliographie= | ||
| Ligne 76 : | Ligne 81 : | ||
http://www.expasy.org/prolune/pdf/chromosomewalk_dossier_pedagogique.pdf | http://www.expasy.org/prolune/pdf/chromosomewalk_dossier_pedagogique.pdf | ||
http://www.journaldunet.com/science/biologie/dossiers/06/0605-depression/4.shtml | |||
Dernière version du 6 novembre 2008 à 07:32
Caractéristiques générales
- Taille du chromosome : 6.7 cm
- Nombres de paires de bases : 199’501’827 pb
- Nombres de gènes : 1’150
- Lieu de séquençage: Allemagne, Chine, Royaume-Uni et USA
- Gène impliqué :
- dans la vision nocturne
- dans la régulation de l'appétit
- dans la vision nocturne
Concept développé par le poster
La Bioinformatique
La bioinformatique constitue un large ensemble de techniques et concepts qui sont nécessaires pour comprendre l'information génétique, comme par exemple les génomes.
La technique qui nous intéresse est le séquençage des gènes et des protéines. Elle permet de classer les organismes suivant leurs différences génétiques (Phylogénie), mais aussi de savoir quel gène code quelle protéine, et de connaitre la structure des protéines.
C'est une science où une grande variété de métiers s'entraident: des biologistes, des informaticiens, des mathématiciens et des physiciens.
Ses limites
Une certaine complexité du matériel génétique dépasse la bioinformatique, qui ne peut détecter lorsque:
- Certaines gènes ne codent que pour une seule protéine.
- D'autres codent pour plusieurs protéines à la fois, par l'épissage alternatif.
- Plusieurs gènes, dans le code génétique entier, codent pour la même protéine.
Le deuxième cas est celui de l'un des gènes du chromosome 3, codant pour deux protéines différentes, que personne n'avait pu détecter avec la bioinformatique auparavant.
Le gène impliqué dans la régulation de l'appétit
Ici, les deux protéines impliquées dans le contrôle de l'appétit, mais codées par un seul gène :
- La Ghréline, qui avertit le corps lorsque celui-ci a besoin de nutriments
- L'Obestatine, qui avertit lorsque le corps est suffisamment rassasié
C'est leur équilibre qui maintient le corps en bonne santé, car s'il est rompu, l'organisme peut tendre vers l'obésité ou l'anorexie. Il faut toutefois rappeler que notre appétit est aussi guidé par nos émotions et nos habitudes alimentaires, un dérèglement peut être donc dû à des facteurs physiologiques, psychologiques, ou culturels.
Développement par questions
Comment se fait-il qu'un gène puisse coder plusieurs protéines différentes?
Comme dans ce cas, la Ghréline et l'Obestatine sont deux protéines synthétisées à partir du même gène.
Cela est possible par l' épissage alternatif: Lors de la synthèse des protéines, une fois que l'ARN s'est fait transcrire mais avant qu'il sorte du noyau, il doit passer par une étape de maturation (pour donner un ARNm mature) celle-ci comportant trois étapes:
- l'ajout d'une queue poly-A sur l'extrémité 3'
- l'ajout d'une coiffe 5'
- l'épissage
C'est cette dernière partie qui permet parfois que deux protèines puissent être produites par un seul gène, car dans cette étape, l'ARNm est épuré de ses parties non-codantes (nommées introns) pour qu'il ne reste plus que les parties codantes pour des protéines (celles ci nommées exons). Seulement, il peut y avoir un épissage alternatif, mécanisme parfaitement identique, sauf que certains exons peuvent aussi se faire éliminer parmi les introns. Cela faisant plusieurs types d'ARNm matures, certains possédant des exons que d'autres n'ont pas et inversement: des protéines donc différentes vont être synthétisées, comme ici pour la Ghréline et l'Obestatine.
Voir Annexe 1
Anorexie et Boulimie: problèmes simplement liés aux gènes?
C'est une question controversée, car actuellement le taux des cas anorexiques subit une très forte hausse: c'est la surenchère des médias qui utilisent de plus en plus de filles maigres que l'ont suspecte coupable. Tout d'abord, les jeunes filles (et les jeunes hommes mais plus rarement) se font donc un idéal physique lié à ces modèles, et cela leur est destructeur. Les deux protéines (Ghréline et Obestatine), suivant leur équilibre, favorisent donc ce déséquilibre psychologique: le gène qui les code est appelé gène de prédispositions. (voir Question " Qu'est ce qu'un gène de prédisposition?")
Alors pourquoi ce fait-il que ce problème ne se rencontre pas dans les pays en voie de développement?
On pense que là où la nourriture est encore considérée comme difficile d'accès, et où toute son importance est véritablement comprise, il faudrait un déséquilibre génétique plus important que dans les pays occidentaux.
Qu'est ce qu'un gène de prédisposition?
Un gène de prédisposition va faire tendre l'organisme vers un déséquilibre, une maladie ou bien même un cancer: Cela va augmenter ses chances de contracter ces pathologies sans toutefois l'y condamner. On peut donc maintenant, en examinant le matériel génétique, prédire ses chances de tomber malade plus tard de telle ou telle maladie ou cancer, et donc de faire des statistiques sur les chances de morts. Ceci donne un problème étique à cette démarche qui se voulait préventive, ainsi qu'un problème qui influencerait les assurances.
Il y a bien-sûr aussi des gènes de prédispositions pour des maladies jugées psychologiques, comme la dépression. La réelle difficulté de ce sujet est le fait que les facteurs culturels et physiologique influencent eux aussi le malade. Justement pour le cas de la dépression, c'est une maladie psychologique où le gène (5-HTTLPR), impliqué dans le transport de la sérotonine, influence le développement de la maladie suivant sa longueur courte ou sa longueur longue. D'après les statistiques, si une personnes possèdent les gènes courts, elle a 4 fois plus de chance de contracter une dépression qu'une autre ayant les gènes longs.
Bibliographie
http://www.expasy.org/prolune/pdf/chromosomewalk_parcours_jeune_public.pdf
http://www.expasy.org/prolune/pdf/chromosomewalk_caracteristiques_chromosomes.pdf
http://www.expasy.org/prolune/pdf/chromosomewalk_dossier_pedagogique.pdf
http://www.journaldunet.com/science/biologie/dossiers/06/0605-depression/4.shtml
retour à Chromosome_Walk
retour à Accueil