« Chromosome 19 » : différence entre les versions

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== Qu'est-ce qu'une cellule?==
== Qu'est-ce qu'une cellule?==


C'est l'unité de base de tout être vivant. {{co|peut-être pourriez vous trouver une définition meilleure dans le lexique du Campbell par exemple}}[[Utilisateur:Pierre.brawand|Pierre.brawand]] 30 octobre 2008 à 22:53 (MET) <br>
C'est '''l'unité structurale et fonctionnelle fondamentale de la vie.'''Le corps humain possède de nombreux types de cellules qui présentent différents caractères.La cellule contient les éléments principaux lui permettant de fonctionner.
Le corps humain comporte de nombreux types de cellules qui présentent des différentes formes de caractère, la cellule présentée ici est une cellule indifférencier de base qui contient les éléments principaux lui permettant de fonctionner
{{co|différents caractères ou différentes formes mais pas différentes formes de caractères. De plus la phrase est trop longue.... Vous dite "la cellule présentée... laquelle? présentée où?}}[[Utilisateur:Pierre.brawand|Pierre.brawand]] 30 octobre 2008 à 22:53 (MET)


== Qu'est ce que le zygote et comment fonctionne -il?==
== Qu'est ce que le zygote et comment fonctionne -il?==
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===Est-ce que ces cellules contiennent les mêmes gènes?===
===Est-ce que ces cellules contiennent les mêmes gènes?===
Oui, mais à un certain stade embryonnaire, elles vont se spécialiser en n’utilisant que les gènes dont elles ont besoin.
Oui toutes les cellules ont les même gènes.Cependant à un certain stade embryonnaire, celles-ci activeront leurs gènes différemment et vont se spécialiser selon leurs fonctions.
Ces cellules donnent ont toutes une structure et une fonction propres. Par exemple:
'''Exemple :'''
* les animaux possèdent des cellules musculaires qui leur permettent de se déplacer, ainsi que des neurones (cellules nerveuses) qui transmettent des stimulus aux cellules musculaires.
* les végétaux possèdent les cellules du mésophylle qui effectuent la photosynthèse, et les cellules stomatiques autour des stomates (pores) régissent la circulation d'air entre l'intérieur et l'extérieur des feuilles.
Le mécanisme du développement embryonnaire doit donc mener non seulement à la création de différents types de cellules, mais également à la formation de structures d'ordre supérieur ayant une configuration tridimentionel


== Comment fait-on pour définir des différence entre ces lignées cellulaires.?==
== Comment fait-on pour définir des différence entre ces lignées cellulaires.?==
La différenciation cellulaire peut être défini comme l'ensemble des processus aboutissant à l'acquisition par une cellule donnée de structures et de fonctions spécialisées. Le développement embryonnaire conduit, à partir d'une cellule unique (oeuf fécondé ou zygote), à l'apparition de plusieurs lignées de cellules différant par leur forme, leur position, et leur fonction. <br>Chez l'embryon, la différenciation de cellule et la morphogénèse sont couplées; de ce couple résulte la formation des tissus et des organes. <br>Les événements de différenciation se produisent dans le temps et l'espace, selon un schéma hautement organisé  invariable pour une espèce donnée. <br>Après les étapes de division et d'élongation, les cellules vont se différencier, c'est à dire se modifier structurellement en se spécialisant physiologiquement.
Tout d'abord, au cours d'un développement embryonnaire, les cellules, tout en se multipliant subissent une '''différenciation cellulaire'''; c'est le processus par lequel elles acquiert des structures et des fonctions spécialisées.Les cellules de différents types ne sont pas distribués par hasard:elles sont groupées en tissus et en organes.La morphogénèse (ensmemble des mécanismes physique déterminant la forme de l'organisme)les triera.
Les différences entre les types de cellules ne sont pas attribuables à la présence de différents gènes, mais plutôt à l'expression génique différentielle, c'est-à-dire à l'expression de gènes différents par des cellules dont le génome est identique.
Ce qui crée plusieurs types de cellules différenciées.
Le développement embryonnaire conduit, à partir d'une cellule unique (oeuf fécondé ou zygote), à l'apparition de plusieurs lignées de cellules différant par leur forme, leur position, et leur fonction. <br>Après les étapes de division et d'élongation, les cellules vont se différencier, c'est à dire se modifier structurellement en se spécialisant physiologiquement.<br>
Les différences entre les types de cellules ne sont pas attribuables à la présence de différents gènes, mais plutôt à l'expression génique différentielle, c'est-à-dire, comme dit précedemment toutes les cellule ont le même génome.En effet, celles-ci activeront les gènes dont elles ont besoin différement.
Pour définir des différences entre ces lignées cellulaires on peut soit :
Pour définir des différences entre ces lignées cellulaires on peut soit :
* observer  l'expression génique différentielle, soit l'expression de gènes différents par des cellules dont le génome est identique.
* observer les étapes principales de l'expression d'un gène codant pour une protéine.
* observer les étapes principales de l'expression d'un gène codant pour une protéine, soit la production des protéines.
* observer la production des protéines.
Et ces 2 observations se font grâce à la technique de la protéomique qu'on explique ci-dessous.


==Qu'est-ce que l'analyse protéomique?==
==Qu'est-ce que l'analyse protéomique?==
La protéomique s’intéresse à l’étude du protéome, c’est-à-dire à l’ensemble des protéines constituant un compartiment cellulaire (ex: les protéines nucléaires), une cellule, un tissu ou un organisme vivant entier.  
La protéomique s’intéresse à '''l’étude''' du protéome, c’est-à-dire à '''l’ensemble des protéine d'une cellule''',organelle, tissu, organe ou organisme à un moment donné et sous des conditions données.
Elle permet notamment d'identifier les protéines extraites d'une culture cellulaire ou d'un tissu, leur localisation dans les compartiments cellulaires ainsi que leurs modifications post-traductionnelles. Elle permet de quantifier les variations de leur taux d'expression en fonction du temps, de leur environnement, de leur état de développement, de leur état physiologique et pathologique, de l'espèce d'origine.
Grâce à cette méthode les chercheurs peuvent tester des milliers de gènes simultanément pour déterminer lesquels sont exprimés dans un tissu, dans diférentes conditions du milieu,dans des états de maladies variés ou à divers stade de développement.
 
== Qu'est-ce que l’électrophorèse bidimensionnelle ?==
 
L'électrophorèse bidimensionnelle '''permet''' à partir de mélanges protéiques complexes de pouvoir visualiser des centaines voire des milliers de protéines sous forme de taches ou « spots ».''' L'image obtenue est suffisante pour mettre en évidence la présence d'isoformes.
En laboratoire, on sait séparer les protéines selon leur taille et leur charge
électrique sur une plaque gélatineuse
Cette séparation effectuée, le chercheur peut explorer une
constellation de taches qui représentent chacune une protéine spécifique
Cette constellation est alors scannée puis analysée à l’aide de programmes bioinformatiques
qui permettent d’attribuer le nom d’une protéine à chaque tache par comparaison avec
d’autres constellations déjà connues.


Elle permet notamment :
# La recherche et l'’identification systématique de l ’ensemble des protéines constituant un organisme, un tissu…
# L’identification des protéines constituant un complexe protéique (interactions protéines-protéines)
# La recherche et l ’identification de protéines impliquées dans des voies de signalisation par exemple par une analyse différentielle (sauvage/mutant).


== Qu'est-ce que l’électrophorèse bidimensionnelle ?==


L'électrophorèse bidimensionnelle permet à partir de mélanges protéiques complexes de pouvoir visualiser des centaines voire des milliers de protéines sous forme de taches ou « spots ». L'image obtenue est suffisante pour mettre en évidence la présence d'isoformes. Elle se déroule en deux étapes:
== CONCLUSION ==
* Elle effectue une séparation des protéines en fonction de leur charge (isoélectrofocalisation, IEF, La résolution que l'on peut attendre de la séparation en première dimension est de l'ordre de 0.01 unités pH et peut être améliorée par l’utilisation d’une zone de point isoélectrique plus étroite.
* La deuxième séparation s'effectue à 90° par rapport à la première, en fonction de la taille moléculaire. Ici, l'isoélectrofocalisation est suivie d'une séparation selon un critère de taille, par une méthode classique d'électrophorèse en gel d'acrylamide en présence d’un détergent ionique, le SDS.


Les gels obtenus sont par la suite colorés puis numérisés.
Grâce à la protéomique il y a une possibilité d'identifier les anomalies à différents stades embryonnaires (lors de la différenciation cellulaire
Souvent, il n'est pas nécessaire de mesurer la quantité absolue de protéine présente, mais de comparer l'abondance relative des protéines dans deux situations. C'est pourquoi, la quantification des protéines est le plus souvent réalisée en comparant les intensités de coloration de protéines séparées par électrophorèse. La détection par des anticorps après transfert des protéines sur une membrane semi-rigide présente également un intérêt, bien que seulement semi-quantitative.
Le résultat de la bioinformatique permet identifier certains gènes humains dont les mutations sont implqués dans les maladies génétiques
C'est un nouveau mode de diagnostique qui offre la possibilité de traitement et de prévention pour les maladies génétiques.


Pour finir, on peut faire un lien entre la protéomique ainsi que la différenciation cellulaire. En effet, on peut grâce à la technique de la protéomique différencier les différentes lignées de cellules.On peut soit observer l'activation de certains gènes, soit regarder la production des protéines pour pouvoir comprendre chaque protéines à quoi elle sert et vice versa.


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Dernière version du 4 novembre 2008 à 19:07

chromosome 19

  • Longueur de l'ADN: 63'811'651 pb soit 2.1 cm
  • Nombre éstimé de gènes: 1'500
  • Séquencé : aux USA
  • Particularité: Le chromosome 19 est le chromosome humain le plus dense en gènes.


Concepts développés par le poster

  • toute première cellule = zygote
  • divison cellulaire = segmentation
  • spécialisation des cellules: on parlera plutôt ici de DIFFERENTIATION et donc de spécialisation
  • Concept de "protéomique": c'est quoi? son utilité?
  • carte géographique des protéines: 2D gel = l’électrophorèse bidimensionnelle

Qu'est-ce qu'une cellule?

C'est l'unité structurale et fonctionnelle fondamentale de la vie.Le corps humain possède de nombreux types de cellules qui présentent différents caractères.La cellule contient les éléments principaux lui permettant de fonctionner.

Qu'est ce que le zygote et comment fonctionne -il?

Le zygote (= cellule oeuf), est la toute première cellule diploïde d'un individu, elle a donc tout le matériel génétique nécessaire à l'édification et au maintien de l'être vivant. Le zygote (diploïde = 2n) est le résultat de la fusion (=fécondation) d'un gamète mâle haploïde (1n) et d'un gamète femelle haploïde (1n). 1n + 1n = 2n
Quelque soit le cycle de développement de l'espèce, l'oeuf sera toujours diploïde (sauf exceptions...). Le zygote se divise en deux copies identiques qui se re-divisent en deux autres parties identiques et ainsi de suite (= segmentation).

Que devienne ces cellules divisés?

On aura donc plusieurs types de cellules qui vont se différencier, entres autres, en cellules musculaires,nerveuses etc..

Est-ce que ces cellules contiennent les mêmes gènes?

Oui toutes les cellules ont les même gènes.Cependant à un certain stade embryonnaire, celles-ci activeront leurs gènes différemment et vont se spécialiser selon leurs fonctions. Exemple :

Comment fait-on pour définir des différence entre ces lignées cellulaires.?

Tout d'abord, au cours d'un développement embryonnaire, les cellules, tout en se multipliant subissent une différenciation cellulaire; c'est le processus par lequel elles acquiert des structures et des fonctions spécialisées.Les cellules de différents types ne sont pas distribués par hasard:elles sont groupées en tissus et en organes.La morphogénèse (ensmemble des mécanismes physique déterminant la forme de l'organisme)les triera. Ce qui crée plusieurs types de cellules différenciées. Le développement embryonnaire conduit, à partir d'une cellule unique (oeuf fécondé ou zygote), à l'apparition de plusieurs lignées de cellules différant par leur forme, leur position, et leur fonction.
Après les étapes de division et d'élongation, les cellules vont se différencier, c'est à dire se modifier structurellement en se spécialisant physiologiquement.
Les différences entre les types de cellules ne sont pas attribuables à la présence de différents gènes, mais plutôt à l'expression génique différentielle, c'est-à-dire, comme dit précedemment toutes les cellule ont le même génome.En effet, celles-ci activeront les gènes dont elles ont besoin différement. Pour définir des différences entre ces lignées cellulaires on peut soit :

  • observer les étapes principales de l'expression d'un gène codant pour une protéine.
  • observer la production des protéines.

Et ces 2 observations se font grâce à la technique de la protéomique qu'on explique ci-dessous.

Qu'est-ce que l'analyse protéomique?

La protéomique s’intéresse à l’étude du protéome, c’est-à-dire à l’ensemble des protéine d'une cellule,organelle, tissu, organe ou organisme à un moment donné et sous des conditions données. Elle permet notamment d'identifier les protéines extraites d'une culture cellulaire ou d'un tissu, leur localisation dans les compartiments cellulaires ainsi que leurs modifications post-traductionnelles. Elle permet de quantifier les variations de leur taux d'expression en fonction du temps, de leur environnement, de leur état de développement, de leur état physiologique et pathologique, de l'espèce d'origine. Grâce à cette méthode les chercheurs peuvent tester des milliers de gènes simultanément pour déterminer lesquels sont exprimés dans un tissu, dans diférentes conditions du milieu,dans des états de maladies variés ou à divers stade de développement.

Qu'est-ce que l’électrophorèse bidimensionnelle ?

L'électrophorèse bidimensionnelle permet à partir de mélanges protéiques complexes de pouvoir visualiser des centaines voire des milliers de protéines sous forme de taches ou « spots ». L'image obtenue est suffisante pour mettre en évidence la présence d'isoformes. En laboratoire, on sait séparer les protéines selon leur taille et leur charge électrique sur une plaque gélatineuse Cette séparation effectuée, le chercheur peut explorer une constellation de taches qui représentent chacune une protéine spécifique Cette constellation est alors scannée puis analysée à l’aide de programmes bioinformatiques qui permettent d’attribuer le nom d’une protéine à chaque tache par comparaison avec d’autres constellations déjà connues.


CONCLUSION

Grâce à la protéomique il y a une possibilité d'identifier les anomalies à différents stades embryonnaires (lors de la différenciation cellulaire Le résultat de la bioinformatique permet identifier certains gènes humains dont les mutations sont implqués dans les maladies génétiques C'est un nouveau mode de diagnostique qui offre la possibilité de traitement et de prévention pour les maladies génétiques.



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