« Approche moléculaire » : différence entre les versions
Aller à la navigation
Aller à la recherche
Aucun résumé des modifications |
|||
| Ligne 7 : | Ligne 7 : | ||
==Marche à suivre== | ==Marche à suivre== | ||
:*Avec l’aide de l’encyclopédie | :*Avec l’aide de l’encyclopédie [http://fr.wikipedia.org/wiki/Accueil Wikipédia], sélectionner un organisme par embranchement (Exemple : ''Pieuvre''). | ||
::Obtenir le Genre (''Octopus''). | ::Obtenir le Genre (''Octopus''). | ||
::Copier cette information.<br> | ::Copier cette information.<br> | ||
:*Ouvrir le site | :*Ouvrir le site [http://beta.uniprot.org/ Uniprot]. Choisir dans le menu '''search in Taxonomy'''. | ||
::Dans '''Query''' coller le genre de l’organisme choisi. | ::Dans '''Query''' coller le genre de l’organisme choisi. | ||
::Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (''Octopus vulgaris'').<br> | ::Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (''Octopus vulgaris'').<br> | ||
| Ligne 28 : | Ligne 28 : | ||
:*Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues dans le Bloc-Notes.<br> | :*Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues dans le Bloc-Notes.<br> | ||
:*Ouvrir le site Clustal W | :*Ouvrir le site [http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ Clustal W]. | ||
::Copier l'ensemble des données du Bloc-Notes (ctrl-A). | |||
::Coller le tout dans le rectangle en bas de la page. | |||
::Pressez '''run'''. | |||
Version du 24 février 2008 à 22:58
Sites utilisés :
Uniprot : Obtention des séquences de protéines
Clustal W : Comparaison des séquences
Phylodendron : Construction des arbres phylogénétiques.
Wikipédia Encyclopédie libre
Marche à suivre
- Avec l’aide de l’encyclopédie Wikipédia, sélectionner un organisme par embranchement (Exemple : Pieuvre).
- Obtenir le Genre (Octopus).
- Copier cette information.
- Ouvrir le site Uniprot. Choisir dans le menu search in Taxonomy.
- Dans Query coller le genre de l’organisme choisi.
- Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (Octopus vulgaris).
- Sélectionner UniProtKB.
- Dans Query ajouter à taxonomy:6645 AND Cytochrome c oxidase subunit 1 ou COl.
- Cliquer sur le numéro d’Accession.
- Cliquer sur le rectangle orange FASTA.
- Copier les séquences obtenues et coller dans le Bloc-Notes.
- Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues dans le Bloc-Notes.
- Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues dans le Bloc-Notes.
- Ouvrir le site Clustal W.
- Copier l'ensemble des données du Bloc-Notes (ctrl-A).
- Coller le tout dans le rectangle en bas de la page.
- Pressez run.