« Approche moléculaire » : différence entre les versions
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==Marche à suivre== | ==Marche à suivre== | ||
: | :*Avec l’aide de l’encyclopédie '''Wikipédia''', sélectionner un organisme par embranchement (Exemple : ''Pieuvre''). | ||
::Obtenir le Genre (Octopus). | ::Obtenir le Genre (''Octopus''). | ||
::Copier cette information. | ::Copier cette information.<br> | ||
:*Ouvrir le site '''Uniprot'''. Choisir dans le menu '''search in Taxonomy'''. | |||
Dans Query | ::Dans '''Query''' coller le genre de l’organisme choisi. | ||
::Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (''Octopus vulgaris'').<br> | |||
Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues. | :*Sélectionner '''UniProtKB'''. | ||
::Dans '''Query''' ajouter à '''taxonomy:6645 AND Cytochrome c oxidase subunit 1 ou COl'''. | |||
::Cliquer sur le numéro d’'''Accession'''.<br> | |||
:*Cliquer sur le rectangle orange '''FASTA'''. | |||
::Copier les séquences obtenues et coller dans le '''Bloc-Notes'''.<br> | |||
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Version du 24 février 2008 à 22:46
Sites utilisés :
Uniprot : Obtention des séquences de protéines
Clustal W : Comparaison des séquences
Phylodendron : Construction des arbres phylogénétiques.
Wikipédia Encyclopédie libre
Marche à suivre
- Avec l’aide de l’encyclopédie Wikipédia, sélectionner un organisme par embranchement (Exemple : Pieuvre).
- Obtenir le Genre (Octopus).
- Copier cette information.
- Ouvrir le site Uniprot. Choisir dans le menu search in Taxonomy.
- Dans Query coller le genre de l’organisme choisi.
- Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (Octopus vulgaris).
- Sélectionner UniProtKB.
- Dans Query ajouter à taxonomy:6645 AND Cytochrome c oxidase subunit 1 ou COl.
- Cliquer sur le numéro d’Accession.
- Cliquer sur le rectangle orange FASTA.
- Copier les séquences obtenues et coller dans le Bloc-Notes.
- Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues.
- Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues.