Expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse
== Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)
Procédure
- Ouvrir Eurexpress -> solution ici
- Parmi les 18'000 gènes étudiés, on peut choisir le gène dont on veut visualiser l'expression en introduisant dans le 2ème champ "quick search" All "for" le symbole ou le nom du gène. P. ex Amy1 pour l'amlayse -> solution ici
- Cliquer la vignette représentant une coupe d'embryon de souris -> solution ici
- On peut choisir (- et +) laquelle des coupes à travers l'épaisseur de l'embryon (de la gauche à la droite) on veut visualiser.
- Un curseur permet de régler le degré de Zoom sur la coupe choisie
- A gauche un arbre anatomique présente les structures. Les coupes présentant une expression forte du gène choisi sont indiquées en rouge pour faciliter leur repérage
- Lorsqu’une image est annotée, un code couleur indique le niveau d’expression de ce gène dans les différentes structures et ce code est conservé dans l’arbre anatomique (rouge pour forte expression, jaune pour expression modérée et bleu pour faible expression)
- La coupe elle-même apparait au centre : ici amylase 1 , section10 (presque au centre) avec une forte expression dans le pancréas qui est bien visible en violet foncé
Ressources supplémentaires
- Une liste de gènes et de leurs protéines que les élèves pourraient connaitre avec leurs symboles a été établie avec Marie-Claude Blatter de l'ISB SIB à l'université de Genève peur donner des idées" .
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Ce magnifique site peut devenir un outil dans notre palette d'enseignant une fois que nous nous construisons un usage, en imaginons les possibles dans les programmes et lui donnons du sens par rapport a nos objectifs. On devine qu'il y a un énorme potentiel en classe, mais il faut baliser quelques chemins, Bio-tremplins vous en a balisés quelques uns pour commencer. Imaginons un usage pédagogique : faire découvrir "éprouver" aux élèves que les gènes ne s'expriment pas partout. Prenant un exemple de protéine exprimée de manière très localisée dans l'embryon, cette activité esquissée se traduit pour les élèves par la question :
Peut-on vérifier que l'insuline est produite principalement dans le pancréas ? (Chez la souris)
On pourrait demander aux élèves de trouver où est exprimé le gène de l'insuline INS 2 ( il y a deux insulines chez la souris et le rat)