Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array

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Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)

Procédure

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici

Prenez un exemple concret à partir d'un SNP par exemple dans le gène CFTR Séquence_du_gène_de_protéines_sur_chromosomes


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/?context=genome&acc=GCF_000001405.39

si nécessaire zoomer à la séquence, choisir un snp (par exemple rs1228922204 et noter la séquence de référence et celle du SNP

-> établir des sondes pour le Micro-array


Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

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